Het klooster had eerder een rosmolen, die 1509 nog werd vermeld (zie A.J. Andreae, Het klooster “Jeruzalem” of het Gerkesklooster, Kollum 1890). In de loop van de 16e eeuw zal de windmolen er voor in de plaats zijn gekomen en die is na de reformatie in particuliere handen gekomen.
Uit 1580 is een vermelding van de molen bekend.
Op 28 april 1638 kwam de molen ter sprake: de Staten gaven toen opdracht alle molens in het Gewest, die geen 300 gulden belasting per half jaar opbrachten, van de spillen (staakijzers) te ontdoen. De molen van Gerkesklooster viel onder deze regeling, hoewel hij wel de vereiste belasting had opgebracht. Toch stond de molen tot 1 mei 1639 stil.
De kaarten van Schotanus uit 1664 en Schotanus-Halma uit 1718 geven de molen aan in Gerkesklooster. De molen komt ook voor in de provinciale belastinglijst van 1751.
Op 19 april 1763 besloten de Staten om de molen te kopen en af te breken.
Bronnen:
-Het molenbestand in Friesland, een overzicht van het aantal der industriemolens in Frl. tot 1900, art. door drs. D.M. Bunskoeke in De Utskoat nr. 40, dec. 1985.
- De Utskoat nr. 76, artikel Een grensgeval door W. Entrop.
- Informatie van Dick Bunskoeke, 15 sept. & 10 okt. 2010.
-----
Meer over de pel- en korenmolens kunt u lezen in het boek: "Gerkesklooster – Stroobos, het dorp dat leeft, door Klaas van der Schuit en Jannie Geertsma-Hamstra.
Gerkesklooster-Stroobos is een tweelingdorp in de provincie Fryslân, gemeente Achtkarspelen.